Numa primeira divisão de trabalho, cada Universidade resultou coordenadora das atividades de um Núcleo Disciplinar, caracterizado por abranger espaços acadêmicos unitários, habitualmente radicados num serviço especializado (faculdade, escola, departamento, instituto, cátedra, etc.)
UNLP - Redes Acadêmicas
UBA - Matemática aplicada
UNR - Microeletrônica
UNL - Planejamento estratégico e gestão universitária
UNER- Educação para a integração
UFSM - Química fina
UFRGS - Sensoriamento Remoto e Meteorologia Aplicada
UNA - Farmacologia de produtos naturais
UR - Virologia molecular
UFSC - Engenharia mecânica e da produção
UFPR - Avaliação Institucional
UFSãoCar - Engenharia dos materiais
Posteriormente respondendo a demandas gerais, a fenômenos que chamam por si mesmos à conjugação de esforços, como no caso do Medio Ambiente, onde nenhum país pode atuar isoladamente, constituiram-se módulos multidisciplinares e surgiram os Comitês Acadêmicos do Grupo Montevidéu:
Meio ambiente
Água
Desenvolvimento tecnológico regional
Desenvolvimento das ciências sociais e políticas
Saúde humana e animal
Na agenda coletiva de trabalho, constam ainda Programas Regionais, Jornadas para Jovens Pesquisadores, Publicações, distribuição de Bolsas e se desenvolvem processo de integração que abrangem o espaço cultural e desportivo, fomentando o conhecimento mútuo das universidades e suas cidades, num esforço para responder ao desafio de um processo integrador mais exigente e completo.